記者3月20日從西湖大學獲悉,該校未來產業研究中心楊劍課題組利用一種新方法,繪制出將疾病與相關細胞分布關聯起來的“導航圖”,并成功定位了抑郁癥、精神分裂癥等復雜疾病的相關細胞及其空間分布。相關研究成果當天在線發表于《自然》。
過去,全球科學家通過全基因組關聯研究(GWAS),成功鑒定出大量與復雜疾病和人體特征相關的遺傳變異。但該技術無法解釋,這些變異如何通過人體中哪些特定的細胞,影響疾病的發生和發展。
“理論上,每個細胞都對應一組活躍表達的標簽基因。這組基因就像是細胞的身份證,反映了細胞的類型、狀態、空間位置等信息。”楊劍介紹,在研究過程中,課題組注意到近年來逐步成熟的新技術——空間轉錄組。GWAS將復雜疾病與特定基因關聯起來,而空間轉錄組技術則將特定基因與細胞位置關聯起來。
于是,研究團隊試圖開發出一種新方法,將兩種技術方法結合起來,以基因為橋梁,將復雜疾病與細胞位置對應起來。
基于公共數據庫中的大腦空間轉錄組數據,經過反復修改與調試,他們研發出一個創新性的數據分析模型,并將其命名為“gsMap”。該模型就像一張可以追蹤疾病相關細胞的“導航圖”。利用它,不僅能夠識別復雜疾病所對應的細胞類型,還能“定位”到這些細胞在人體中的位置。
“借助gsMap,我們發現,不論是精神分裂癥還是抑郁癥,都與谷氨酸能神經元有顯著關聯。但在對應不同疾病時,它們的分布位置是不同的。”楊劍說。
具體而言,研究團隊發現,與抑郁癥關聯的谷氨酸能神經元,集中分布在中腦和內側前額葉皮層深部。分析顯示,這些神經元表現出顯著的可塑性特征:在受到特定刺激后,神經元突觸會表現出較為靈活的變化,既可以互相連接,也可以互相斷開。
不僅如此,活躍在這個位置的基因,與精神藥物靶向的基因重合度較高,是其他大腦皮層區域的16倍,突顯了該腦區在抑郁癥干預和靶向治療中的潛在作用。
此外,與精神分裂癥關聯的谷氨酸能神經元,集中分布于大腦皮層和海馬區域,這些位置與智商相關的細胞位置非常接近,甚至存在重疊。
記者3月20日從西湖大學獲悉,該校未來產業研究中心楊劍課題組利用一種新方法,繪制出將疾病與相關細胞分布關聯起來的“導航圖”,并成功定位了抑郁癥、精神分裂癥等復雜疾病的相關細胞及其空間分布。相關研究成果當天在線發表于《自然》。
過去,全球科學家通過全基因組關聯研究(GWAS),成功鑒定出大量與復雜疾病和人體特征相關的遺傳變異。但該技術無法解釋,這些變異如何通過人體中哪些特定的細胞,影響疾病的發生和發展。
“理論上,每個細胞都對應一組活躍表達的標簽基因。這組基因就像是細胞的身份證,反映了細胞的類型、狀態、空間位置等信息。”楊劍介紹,在研究過程中,課題組注意到近年來逐步成熟的新技術——空間轉錄組。GWAS將復雜疾病與特定基因關聯起來,而空間轉錄組技術則將特定基因與細胞位置關聯起來。
于是,研究團隊試圖開發出一種新方法,將兩種技術方法結合起來,以基因為橋梁,將復雜疾病與細胞位置對應起來。
基于公共數據庫中的大腦空間轉錄組數據,經過反復修改與調試,他們研發出一個創新性的數據分析模型,并將其命名為“gsMap”。該模型就像一張可以追蹤疾病相關細胞的“導航圖”。利用它,不僅能夠識別復雜疾病所對應的細胞類型,還能“定位”到這些細胞在人體中的位置。
“借助gsMap,我們發現,不論是精神分裂癥還是抑郁癥,都與谷氨酸能神經元有顯著關聯。但在對應不同疾病時,它們的分布位置是不同的。”楊劍說。
具體而言,研究團隊發現,與抑郁癥關聯的谷氨酸能神經元,集中分布在中腦和內側前額葉皮層深部。分析顯示,這些神經元表現出顯著的可塑性特征:在受到特定刺激后,神經元突觸會表現出較為靈活的變化,既可以互相連接,也可以互相斷開。
不僅如此,活躍在這個位置的基因,與精神藥物靶向的基因重合度較高,是其他大腦皮層區域的16倍,突顯了該腦區在抑郁癥干預和靶向治療中的潛在作用。
此外,與精神分裂癥關聯的谷氨酸能神經元,集中分布于大腦皮層和海馬區域,這些位置與智商相關的細胞位置非常接近,甚至存在重疊。
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